На территории Санкт-Петербурга расположено значительное количество водотоков и водоемов. Общая площадь зеркала этих объектов составляет примерно 25,5 млн.кв.м, а суммарная протяженность береговых линий - более 800 км.
На акватории и в водоохранных зонах водотоков и водоемов выполняются следующие виды работ: уборка и очистка акватории и водоохранных зон от мусора и наплавных загрязнений; уборка, дноочистка, ремонт и благоустройство замкнутых водоемов. В целях совершенствования системы уборки акватории и водоохранных зон Санкт-Петербурга, повышения полноты и качества уборки водных объектов в 2000 году был утвержден "Межведомственный график очистки водотоков, водоемов и водоохранных зон Санкт-Петербурга от наплавных загрязнений, водорослей и мусора".
Большое значение для внешнего облика Санкт-Петербурга имеет уборка водной растительности на реках и каналах. Санкт-Петербург является одним из крупнейших объектов международного туризма и отдыха, и его акватория нуждается в ежегодной очистке от водорослей. Как правило, в летний период активное развитие водной растительности ухудшает экологические параметры водотоков и водоемов, затрудняет их проточность, мешает судоходству и создает неприглядный облик каналов и рек центральной части города.
На территории Санкт-Петербурга зарегистрировано свыше 150 замкнутых водоемов с площадью зеркала вод от 0,1 га. Эти водоемы находятся в ведении Комитета по культуре, Управления садово-паркового хозяйства Комитета по благоустройству и дорожному хозяйству, территориальных управлений административных районов города и органов местного самоуправления. Состояние ряда замкнутых водоемов Санкт-Петербурга за последние годы ухудшилось. Отсутствие проточности водоемов в условиях крупного города вызывает их обмеление, увеличение массы донных отложений, мусора и интенсивное зарастание камышом и водорослями. Дноочистке подлежат десятки замкнутых водных объектов.
В водоохранной зоне Невской Губы, Невы, водотоков и водоемов города имеются несанкционированные свалки строительного и другого мусора. Значительная часть прибрежных территорий заводов захламлена, занята под хозяйственные нужды. Наблюдается загрязнение водотоков и водоемов города нефтепродуктами. Нарушается режим хозяйственной деятельности при эксплуатации нефтехранилищ и складов ГСМ. Сложилась негативная тенденция захода плавсредств на акватории Невы и Невской Губы и дальнейшего их длительного отстоя в не приспособленных для этого местах как в навигацию, так и в межнавигационный период. Бесконтрольное размещение судов приводит зачастую к их затоплению и, как следствие, к нарушению природоохранных норм.
На протяжении многих лет водные объекты Санкт-Петербурга являлись зоной активного судоходства и ведения боевых действий. За этот период на акватории города затонуло множество военных кораблей, судов пассажирского и торгового флота и иных плавсредств. Затонувшие суда представляют особую опасность с экологической точки зрения, так как некоторые из них сохраняют в танках нефте-водяные смеси или другие токсические вещества. Определенную опасность представляют затонувшие и брошенные суда для судоходства и водного туризма по рекам, каналам и Финскому заливу.
Основными причинами отмеченных выше недостатков являются ведомственная разобщенность городских структур, ответственных за содержание акваторий и прилегающих к водным территориям объектов, отсутствие должного контроля за реализацией ранее принятых решений, а также несовершенство нормативно-правовой базы на федеральном и городском уровнях.
Для оздоровления, благоустройства и охраны от загрязнения Невской Губы, водотоков и водоемов на территории Санкт-Петербурга необходимо выполнение следующих мероприятий:
- совершенствовать нормативно-правовую базу о закреплении участков акваторий и водоохранных зон Невской Губы, Невы, водотоков и водоемов, расположенных в административных границах города, и порядке размещения плавсредств на акваториях города;
- совершенствование системы контроля за содержанием и использованием акваторий, водотоков и водоохранных зон;
- разработать и утвердить программы по уборке и очистке акваторий водотоков и водоохранных зон от наплавных загрязнений, водорослей и мусора на 2004-2008 гг.;
- произвести проверку акватории Невской Губы, Невы, водотоков и водоемов города в черте города с целью выявления брошенных, полузатопленных и затопленных судов и иных плавсредств, по возможности установить их владельцев;
- разработать оптимальный порядок передачи в собственность города затопленных, полузатопленных и брошенных плавсредств с целью их утилизации и очистки акваторий;
- обеспечить круглогодичную очистку водотоков и водоемов города от мусора и плавающих предметов;
- совершенствовать материально-техническую базу городских служб по уборке и очистке акватории и водоохранных зон от мусора и наплавных загрязнений, дноочистке и благоустройству замкнутых водоемов;
- навести порядок на береговых зонах Невской Губы, Невы, внутренних водоемов и водотоков города, в том числе на территориях промышленных предприятий, с ликвидацией заросших мелководий и скоплений мусора, ликвидировать несогласованные гаражи и временные строения в водоохранных зонах;
- провести реконструкцию и очистку водоподводящих систем дворцовых комплексов пригородов Санкт-Петербурга.