Государственным заказчиком Программы является администрация Алтайского края.
Финансирование мероприятий Программы за счет средств краевого бюджета производится целевым назначением через департамент по охране окружающей среды администрации Алтайского края. Выполнение мероприятий Программы организациями и предприятиями осуществляется посредством заключения государственных контрактов между департаментом по охране окружающей среды администрации Алтайского края и исполнителями программных мероприятий. Конкретные исполнители отдельных мероприятий определяются департаментом по охране окружающей среды администрации Алтайского края на конкурсной основе в соответствии с Федеральным законом от 6 мая 1999 года N 97-ФЗ "О конкурсах на размещение заказов на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг для государственных нужд".