Вопрос:

Организация в 2011 году заключила договор с заказчиком на оказание услуг. Сумма договора установлена с учетом НДС. В том же году, по условиям договора, организация получила 50% предоплату, с суммы которой исчислила и перечислила в бюджет НДС.

В 2012 году организация включена в реестр участников проекта по осуществлению исследований, разработок и коммерциализации их результатов в соответствии с Федеральным законом "Об инновационном центре "Сколково". С сентября 2012, согласно п.1 ст.145_1 НК РФ, использует освобождение от обязанностей налогоплательщика в части исчисления и уплаты налога на добавленную стоимость.