Основной целью Программы является создание системы санитарно - эпидемиологического, экологического, ветеринарного и фитосанитарного надзора и контроля, позволяющих ограничить возможность завоза и предупредить распространение на территории Чувашской Республики особо опасных инфекционных заболеваний людей, животных и растений, а также токсичных веществ. Реализацию этих мероприятий планируется проводить по следующим направлениям;
правовое обеспечение мероприятий;
совершенствование системы организации государственного санитарно - эпидемиологического, экологического, ветеринарного и фитосанитарного надзора и контроля в Чувашской Республике, создание межведомственной системы информационного обеспечения и подготовки кадров;
укрепление и развитие материально-технической базы органов государственного надзора.