Основными задачами Комиссии являются:
2.1. Повышение эффективности государственного и муниципального управления.
2.2. Укрепление законности, усиление ответственности государственных и муниципальных служащих и должностных лиц за принимаемые ими решения.
2.3. Модернизация внутренних административных процессов.
2.4. Формирование системы контроля за деятельностью государственных органов. (данный пункт утратил силу от 16.06.08 N 296-А)
2.5. Повышение качества бюджетных услуг.
2.6. Оптимизация бюджетных расходов.