Реализация мероприятий Программы осуществляется на основе взаимодействия органов государственной власти Иркутской области, органов местного самоуправления муниципальных образований Иркутской области, хозяйствующих субъектов, а также широких слоев населения Иркутской области.
Организация управления Программой представляет собой комплекс решений отраслевого, стратегического, тактического и территориального характера.
Схема управления Программой выглядит следующим образом:
а) управление реализацией Программы осуществляет Правительство Иркутской области;
б) общее руководство и контроль за ходом реализации Программы осуществляет уполномоченный исполнительный орган государственной власти Иркутской области (оперативное управление, ежегодный мониторинг исполнения Программы, корректировка, анализ эффективности реализации Программы);
в) текущий финансовый контроль использования средств федерального и областного бюджетов осуществляется уполномоченными органами государственной власти;
г) формирование нормативной правовой базы субъектами законодательной инициативы;
д) подготовку предложений в План действий Правительства Иркутской области по реализации Программы на очередной финансовый год, отчетов по исполнению мероприятий Программы, проектных инициатив и контроль за реализацией мероприятий в рамках компетенции осуществляют исполнительные органы государственный власти Иркутской области, ответственные за реализацию Программы.