Основной задачей деятельности Управления является осуществление, в пределах своей компетенции, финансового контроля на территории Краснодарского края за своевременным, целевым и рациональным использованием и сохранностью средств краевого бюджета, федеральных средств, получаемых под гарантии краевого бюджета, сохранностью имущества находящегося в государственной собственности Краснодарского края.