Несмотря на стабильный рост объемов промышленного производства в последние годы, уровень развития отрасли в Краснодарском крае не соответствует его потенциалу и потребностям. Основные проблемы в промышленности обусловлены:
неразвитостью региональной и межрегиональной кооперации и интеграции;
низкой инвестиционной привлекательностью большинства предприятий отрасли;
дефицитом энергетических ресурсов. На экономике края сказывается дефицит электрической энергии, составляющий до 60 процентов от потребности. Получаемая с федерального оптового рынка энергии и мощности (ФОРЭМ) электроэнергия на 20 - 25 процентов дороже производимой в крае, что отрицательно влияет на конкурентоспособность кубанской продукции;
высокой степенью износа основных производственных фондов (средний уровень износа - 50 процентов);
низким техническим уровнем большинства промышленных производств;
отсутствием безотходных технологий использования низкосортной древесины, доля которой в крае составляет 60 процентов от общего объема производимой древесины, недостаточным количеством лесовозных дорог;
отсутствием технологий комплексного использования природного сырья, вторичных ресурсов и промышленных отходов в производстве строительных материалов;
низким уровнем использования производственных мощностей, который составляет в среднем 52 процента, в химической и нефтехимической промышленности - около 40 процентов, производстве пиломатериалов - 37 процентов, легкой промышленности - 28 процентов;
недостатком оборотных средств, не позволяющим организовать ритмичную работу предприятий.