2. На охранную зону возлагаются следующие задачи:
охрана видов животных, стации которых выходят за пределы территории заповедника (снежный барс, сибирский козерог, сибирская косуля, алтайский улар, тетерев и др.);
осуществление мероприятий по охране и восстановлению запасов растений эндемиков (борец двухцветковый, остролодочник верхнеенисейский, ветреница енисейская и др.);
мониторинг экосистем в зоне водохранилища Саяно-Шушенской ГЭС в соответствии с задачами заповедника;
разработка проектов, компенсирующих природоохранные мероприятия по восстановлению численности редких и хозяйственно ценных видов животных (скопа, выдра, норка и др.);
проведение туров с целью просвещения в области охраны окружающей природной среды и заповедного дела;
сохранение и содействие традиционным направлениям природопользования: мараловодству, пчеловодству, охотничьему хозяйству, сбору дикорастущих растений, ягод, плодов и семян, пастбищному животноводству;
проведение научно обоснованных мероприятий по сохранению и восстановлению структуры заповедных экосистем в рамках выполнения основных задач биосферного заповедника.