Реализация среднесрочной городской целевой программы осуществляется за счет средств городского бюджета, предусмотренных на программную деятельность соответствующих структур Правительства Москвы, путем привлечения средств из внебюджетных источников и путем формирования бюджетной заявки в соответствии с возможностями Федерального бюджета, а также посредством создания соответствующих финансовых и производственно-технологических структур, нацеленных на мирокультурную сферу.
Затраты, связанные с реализацией первого этапа программы, уже предусмотрены по текущему году. Затраты на оставшиеся два года будут заявлены при формировании очередных проектов бюджета города Москвы. Размеры бюджетного финансирования Программы на последующие годы заложены без увеличения объемов традиционно сложившихся затрат по соответствующим направлениям.
Первый этап реализации Программы (2002 год) включает в себя, главным образом, разработку нормативных документов и конкретизацию мероприятий, способствующих формированию в массовом сознании, в том числе с помощью средств массовой информации, позитивного отношения к толерантности как социальной норме. Программа толерантности на этом этапе финансируется за счет городского бюджета. Участие субъектов Российской Федерации, согласно Федеральной программе, начинается на втором этапе (2003 год), но в основном приходится на третий этап (2004 год) - этап масштабного внедрения результатов работ предыдущих этапов. Предполагается, что финансирование Программы за счет Федерального бюджета будет осуществляться на основе соглашения между Федеральным государственным заказчиком Федеральной Программы и органами исполнительной власти Москвы как субъекта Российской Федерации.
Общие расходы на Программу прогнозируются в размере 250 млн. рублей. В том числе, затраты на реализацию Программы путем выделения бюджетных средств на программную деятельность соответствующих структур Правительства Москвы составляют 196 млн. рублей, планируемое привлечение средств из внебюджетных источников - 54 млн. рублей.