Реализация Программы осуществляется на основе контрактов, заключаемых с исполнителями подпрограмм различными комитетами и ведомствами. Контракт определяет права и обязанности заказчика и исполнителя, регулирует их отношения при выполнении контракта, в том числе предусматривает контроль за ходом работ по выполнению договора.
Заказчик подпрограмм с учетом выделяемых на реализацию Программы финансовых средств ежегодно уточняет целевые показатели и затраты по программным мероприятиям, механизм реализации Программы, состав исполнителей.
Центральным принципом реализации Программы является ее открытость для любых субъектов деятельности, организаций, учреждений, заинтересованных в развитии профессионального образования, молодежного предпринимательства и активной социально-трудовой адаптации молодежи Москвы.
В зависимости от ведомственных интересов, Программа может быть реализована через включение отдельных, присущих только ей подпрограмм в уже существующие ведомственные программы, а может включать в себя действующие программы и концепции различных ведомств и организаций.