Количество и распределение станций по акватории должно соответствовать особенностям морфологии водоема. При этом учитываются характер котловины, глубина, изрезанность берегов, расчлененность.
2.1. Не только при регулярных, но и при кадастровых (кратковременных) исследованиях водоемов особенно важны выбор местоположения станций и определение их числа с тем расчетом, чтобы охватить все зоны водоема, включая заросли макрофитов. Для получения достоверных результатов минимальное число станций в каждой зоне водоема должно быть не меньше трех.
В малых озерах (менее 100 га) с блюдцеобразным ложем и небольшими глубинами достаточен отбор проб на 4-5 станциях, из которых 2-3 должны приходиться на основную часть водоема.
В озерах площадью более 100 га, с хорошо выраженной литоралью, при наличии крупных заливов или обособленных плесов необходимо:
а) в каждом плесе установить сетку станций по поперечным разрезам (не менее 2-3 разрезов), с тем чтобы на каждом разрезе было не меньше трех точек;
б) в каждом заливе, если его площадь не менее 5% площади водоема, установить 2-3 точки для взятия проб с таким расчетом, чтобы охватить прибрежную и центральную зоны, различающиеся по глубине.
Количество станций может быть уменьшено или увеличено в зависимости от степени неоднородности водоема и при выполнении специальных исследований. Например, при изучении зоопланктона литорали, представленной несколькими биотопами или растительными ассоциациями, число станций следует увеличить в соответствии с количеством биотопов (ассоциаций) и долей, которую они занимают в пределах зоны.
2.2. При детальном изучении зоопланктона водоема, проводящемся в течение вегетационного сезона, всего года или нескольких лет с целью выяснения видового состава, его распределения в пространстве и во времени, выявления биоценотических группировок, внутри- и межбиоценотических связей, наконец, при изучении биологии и продуктивности массовых видов, необходимо выбрать точки для постоянных станций, на которых будут производиться периодические сборы планктонных животных. При выборе таких точек следует учитывать результаты единовременного обследования водоема и наметить по одной-две станции на каждом характерном биотопе. Для небольшого озера с однообразным характером котловины и глубинами не более 10 м достаточно четырех-пяти постоянных станций. В крупных водоемах, имеющих сильно изрезанную береговую линию, сложный рельеф дна и развитую литоральную зону с зарослями макрофитов, количество постоянных станций должно быть увеличено.
2.3. Сроки взятия проб зоопланктона тесно связаны, во-первых, с периодичностью в жизни водоема, во-вторых, с конкретными целями исследования и в каждом отдельном случае могут резко различаться.
2.3.1. В том случае, когда целью наблюдений является изучение видового состава зоопланктона, состава и взаимодействия биоценотических группировок, их изменения во времени (в сезонном аспекте), сборы должны проводиться в течение всего года со следующей периодичностью: вегетационный сезон - один раз в декаду, один раз в октябре и не менее двух раз в подледный период (январь, март).
2.3.2. Если проводится изучение изменений состава и количественного развития планктона в результате обработки водоема ядохимикатом, применяется следующая периодичность отбора проб: биологическая съемка непосредственно перед обработкой; через 1, 3, 5, 10, 15, 20, 30, 45 и 60 суток после обработки (при условии, что водоем обрабатывается в первой половине лета); далее сборы проводятся один раз в месяц; в подледный период пробы собираются ранней весной (в марте и, в северных районах, в апреле).
Указанная периодичность сборов диктуется неодинаковой скоростью гибели и восстановления различных видов. Только достаточно частые сборы, особенно в течение первого месяца после внесения ядохимиката, позволяют проследить за ходом этого процесса. Последующие изменения мало отличаются от обычных сукцессий, определяемых сезонными факторами, поэтому достаточно проводить сборы один раз в сезон.
2.3.3. При исследованиях зоопланктона, связанных с изучением биологии массовых видов и их продукции, частота общих съемок должна быть такой же, как при фаунистико-экологическом изучении населения водной толщи.
При составлении плана исследования водоема необходимо учитывать такой существенный фактор, как бюджет времени гидробиолога. Даже у опытного исследователя просчет пробы зоопланктона под бинокуляром, определение видового состава и возрастных стадий массовых форм при параллельном их измерении занимает не менее одного-двух часов. Средняя производительность труда зоопланктонолога редко превышает 4-5 проб за рабочий день. Кроме первичной обработки материалов потребуется время для расчета численности, биомассы и продукции, а также для оформления результатов работы в виде отчета или статьи. Опыт показывает, что количество собранных за год проб не должно быть более 200.